细菌感染

最常见的感染来自龋病、牙髓病，其次是牙周病。这些疾病可能导致牙髓组织感染，进而向根尖周组织扩散引起根尖周炎。根尖周炎的血源性感染(受过损伤的牙髓吸引细菌至损伤部位导致的感染)极为少见。

根尖周炎的细菌主要来自感染根管，根管内通常是5~8种细菌的混合感染，其中以1~2种细菌为优势菌。较常见的优势菌有小咻单胞菌、普氏菌、梭形杆菌、消化链球菌、放线菌、真杆菌、韦荣球菌等。

物理刺激

牙齿受到不当的外力时，如牙外伤或慢性咬合创伤等，均可能使根尖周组织损伤，进而造成根尖周炎。

治疗因素

根管治疗过程中，根管器械、药物等超出根尖孔导致的局部刺激，或将感染带入根尖周组织，也可引起根尖周炎。